科技日報記者 魏依晨 通訊員 劉麗婷
近日,江西省林業科學院聯合省林業科技實驗中心研究采用PacBio HiFi長讀長測序結合Hi-C技術在國內率先獲得首個染色體級別花櫚木全基因組。相關研究論文發表于《自然》子刊《科學數據》。
據介紹,花櫚木染色體水平基因組總大小為2.69Gb,BUSCO評估驗證基因組完整性達98.20%,其中共功能注釋到37366個基因,鑒定到2518個rRNA和1120個tRNA等非編碼RNA。
該基因組的發布填補了花櫚木遺傳學研究的空白,作為紅豆屬物種里少有的大基因組,其高重復序列比例與LTR主導的特征,為解析豆科基因組擴張機制提供了新視角,同時為花櫚木藥用成分生物合成途徑的解析及紅豆屬相關瀕危物種的保護與資源綜合開發利用提供了重要分子依據與理論基礎。
(江西省林科院珍貴樹種團隊供圖)